由中国管理科学研究院《中国大学评价》课题组武书连、吕嘉、郭石林主持的《2009中国大学评价》已经完成。依惯例，由SCD源期刊、CSSCI源期刊《科学学与科学技术管理》杂志刊出。在此之前，中国统计出版社出版的2009中国大学评价的普及版本《挑大学 选专业–2009高考(Q吧)志愿填报指南》已在全国出版发行。该书由《中国大学评价》课题组组长武书连主编。
在《2009中国大学评价》中，清华大学以280.15分再列榜首，北京大学、浙江大学分别以224.66分、219.14分获得第2、第3名。至此，在《中国大学评价》中，清华大学已经连续13年位居榜首。清华大学、北京大学、浙江大学已经连续10年保持中国大学前三名。2009中国大学评价显示，浙江大学在科学研究领域以122.01分首次领先北京大学（120.74分）。
进入2009中国大学排行榜第4名至第10名的大学依次是：第4名上海交通大学，第5名南京大学，第6名复旦大学，第7名中国科学技术大学，第8名中山大学，第9名华中科技大学，第10名武汉大学。与上一年度的前10名相比，前7名顺序不变，中山大学重返前10名，位列第8。华中科技大学、武汉大学因中山大学上升到第8名而分别下降到第9名和第10名。西安交通大学没有保持住前10名。
《中国大学评价》课题组同时评出了2009年15所中国一流大学。与上一年度的16所中国一流大学名单相比较，中国农业大学因课题组提高了中国一流大学的标准而落选，没有新的大学进入中国一流大学。
《中国大学评价》课题组还选出了2009年37所中国研究型大学。南京农业大学首次进入研究型大学。这是继上年南京航空航天大学进入研究型大学后，江苏省又一所科研强校进入研究型大学。至此，江苏省的研究型大学数量已经达到4所，仅次于北京市的7所和上海市的5所。
与上年的中国大学前100名相比，首都师范大学首次进入前100名，位列第95名。太原理工大学重返前100名，列第99名。
《中国大学评价》课题组同时完成了理学、工学、农学、医学、哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、管理学等11个学科门类的排名。学科门类排名显示，在11个学科门类中，北京大学共获得6个第1名，即：理学、医学、哲学、经济学、文学、历史学第1名。清华大学获得工学、管理学第1名，中国人民大学获得法学第1名，北京师范大学获得教育学第1名，中国农业大学获得农学第1名。
课题组也对中国大学250多个本科专业进行了排名，北京大学、清华大学的本科专业第一名数量仍然大幅领先其他大学。
2009中国大学排行榜的全部内容见武书连主编、中国统计出版社出版的《挑大学 选专业-2009高考志愿填报指南》。
附表: 2009中国大学前100名
| 排名 | 校名 | 总得分 | 人才培养 | 科学研究 | 分省 排名 | 学校类型 | 学校参考类型 | ||||||
| 得分 | 研究生培养 | 本科生培养 | 得分 | 自然科学研究 | 社会科学研究 | ||||||||
| 1 |
清华大学
|
280.15 | 120.95 | 85.75 | 35.20 | 159.20 | 140.47 | 18.74 | 京 | 1 | 理工 | 理科类 | 研究1型 |
| 2 |
北京大学
|
224.66 | 103.92 | 66.36 | 37.57 | 120.74 | 85.09 | 35.65 | 京 | 2 | 综合 | 综合类 | 研究1型 |
| 3 |
浙江大学
|
219.14 | 97.13 | 65.86 | 31.26 | 122.01 | 104.91 | 17.10 | 浙 | 1 | 综合 | 理科类 | 研究1型 |
| 4 |
上海交通大学
|
149.73 | 65.24 | 45.60 | 19.65 | 84.49 | 77.76 | 6.73 | 沪 | 1 | 综合 | 理科类 | 研究1型 |
| 5 |
南京大学
|
140.70 | 67.68 | 42.25 | 25.43 | 73.02 | 52.22 | 20.80 | 苏 | 1 | 综合 | 文理类 | 研究1型 |
| 6 |
复旦大学
|
110.98 | 52.12 | 31.47 | 20.65 | 58.86 | 42.25 | 16.60 | 沪 | 2 | 综合 | 综合类 | 研究1型 |
| 7 |
中国科学技术大学
|
103.11 | 50.89 | 33.90 | 17.00 | 52.22 | 50.45 | 1.77 | 皖 | 1 | 理工 | 理科类 | 研究1型 |
| 8 |
中山大学
|
98.91 | 45.10 | 27.76 | 17.34 | 53.80 | 37.86 | 15.94 | 粤 | 1 | 综合 | 综合类 | 研究1型 |
| 9 |
华中科技大学
|
98.67 | 47.29 | 27.08 | 20.22 | 51.38 | 44.78 | 6.60 | 鄂 | 1 | 理工 | 理科类 | 研究2型 |
| 10 |
武汉大学
|
96.16 | 45.01 | 26.65 | 18.37 | 51.14 | 33.36 | 17.79 | 鄂 | 2 | 综合 | 综合类 | 研究2型 |
| 11 |
吉林大学
|
95.28 | 47.36 | 25.76 | 21.60 | 47.92 | 38.07 | 9.86 | 吉 | 1 | 综合 | 综合类 | 研究2型 |
| 12 |
西安交通大学
|
87.71 | 43.57 | 22.58 | 20.99 | 44.14 | 35.05 | 9.09 | 陕 | 1 | 综合 | 文理类 | 研究2型 |
| 13 |
四川大学
|
86.56 | 41.69 | 23.19 | 18.50 | 44.87 | 35.28 | 9.59 | 川 | 1 | 综合 | 综合类 | 研究2型 |
| 14 |
哈尔滨工业大学
|
82.06 | 41.08 | 24.01 | 17.07 | 40.98 | 39.38 | 1.60 | 黑 | 1 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 15 |
南开大学
|
79.82 | 35.79 | 24.50 | 11.29 | 44.02 | 26.08 | 17.94 | 津 | 1 | 综合 | 文理类 | 研究1型 |
| 16 |
山东大学
|
77.98 | 38.87 | 19.75 | 19.12 | 39.11 | 28.89 | 10.22 | 鲁 | 1 | 综合 | 综合类 | 研究2型 |
| 17 |
北京师范大学
|
71.38 | 31.85 | 19.91 | 11.95 | 39.53 | 15.74 | 23.79 | 京 | 3 | 师范 | 文理类 | 研究1型 |
| 18 |
天津大学
|
66.66 | 32.80 | 19.60 | 13.20 | 33.86 | 30.77 | 3.09 | 津 | 2 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 19 |
中南大学
|
61.09 | 29.32 | 16.14 | 13.18 | 31.77 | 29.22 | 2.55 | 湘 | 1 | 综合 | 理科类 | 研究2型 |
| 20 |
东南大学
|
57.92 | 27.30 | 16.34 | 10.95 | 30.62 | 27.38 | 3.25 | 苏 | 2 | 综合 | 工学类 | 研究2型 |
| 21 |
中国人民大学
|
56.67 | 25.47 | 14.50 | 10.97 | 31.19 | 0.71 | 30.48 | 京 | 4 | 综合 | 文科类 | 研究2型 |
| 22 |
北京航空航天大学
|
54.51 | 24.64 | 15.71 | 8.93 | 29.87 | 27.65 | 2.22 | 京 | 5 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 23 |
厦门大学
|
53.01 | 24.59 | 15.91 | 8.68 | 28.41 | 15.78 | 12.63 | 闽 | 1 | 综合 | 文理类 | 研究2型 |
| 24 |
大连理工大学
|
47.67 | 22.75 | 14.23 | 8.52 | 24.92 | 23.41 | 1.50 | 辽 | 1 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 25 |
同济大学
|
45.93 | 22.81 | 12.30 | 10.51 | 23.11 | 20.85 | 2.27 | 沪 | 3 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 26 |
华南理工大学
|
45.74 | 20.31 | 13.04 | 7.27 | 25.43 | 23.80 | 1.63 | 粤 | 2 | 理工 | 工学类 | 研究2型 |
| 27 |
重庆大学
|
41.81 | 23.09 | 9.80 | 13.29 | 18.73 | 15.03 | 3.70 | 渝 | 1 | 综合 | 文理类 | 研究2型 |
| 28 |
兰州大学
|
41.78 | 20.08 | 11.96 | 8.12 | 21.70 | 18.69 | 3.01 | 甘 | 1 | 综合 | 理学类 | 研究2型 |
| 29 |
西北工业大 |
||||||||||||